Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cwc22Q8C5N3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cwc22Q8C5N3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms