Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc90bQ8C3X2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc90bQ8C3X2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms