Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp38Q8BW70 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp38Q8BW70 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Usp38Q8BW70 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Usp38Q8BW70 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Usp38Q8BW70 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Usp38Q8BW70 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp38Q8BW70 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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