Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU04

Ubr7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr7Q8BU04 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubr7Q8BU04 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms