Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp54Q8BL06 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms