Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zcchc4Q8BKW4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms