Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnrc6bQ8BKI2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms