Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4dQ8BGV9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms