Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
U2af1l4Q8BGJ9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
U2af1l4Q8BGJ9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
U2af1l4Q8BGJ9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af1l4Q8BGJ9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af1l4Q8BGJ9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af1l4Q8BGJ9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af1l4Q8BGJ9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af1l4Q8BGJ9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af1l4Q8BGJ9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af1l4Q8BGJ9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af1l4Q8BGJ9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af1l4Q8BGJ9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af1l4Q8BGJ9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af1l4Q8BGJ9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af1l4Q8BGJ9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U2af1l4Q8BGJ9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
U2af1l4Q8BGJ9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms