Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8BGC1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8BGC1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8BGC1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8BGC1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8BGC1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8BGC1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8BGC1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8BGC1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8BGC1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8BGC1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8BGC1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8BGC1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8BGC1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8BGC1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8BGC1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms