Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.3Q85ZW6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms