Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.6Q85ZW5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M10.6Q85ZW5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M10.6Q85ZW5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M10.6Q85ZW5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M10.6Q85ZW5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms