Protein–RNA interactions for Protein: Q810F0

Prima1, Proline-rich membrane anchor 1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prima1Q810F0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prima1Q810F0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms