Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

Predictions only

Length 4,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms