Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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NanogQ80Z64 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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NanogQ80Z64 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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NanogQ80Z64 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NanogQ80Z64 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NanogQ80Z64 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NanogQ80Z64 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NanogQ80Z64 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NanogQ80Z64 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NanogQ80Z64 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NanogQ80Z64 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NanogQ80Z64 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NanogQ80Z64 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NanogQ80Z64 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NanogQ80Z64 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NanogQ80Z64 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NanogQ80Z64 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NanogQ80Z64 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NanogQ80Z64 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NanogQ80Z64 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NanogQ80Z64 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NanogQ80Z64 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NanogQ80Z64 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NanogQ80Z64 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NanogQ80Z64 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NanogQ80Z64 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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