Protein–RNA interactions for Protein: Q80YD6

Sergef, Secretion-regulating guanine nucleotide exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SergefQ80YD6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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SergefQ80YD6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SergefQ80YD6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SergefQ80YD6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SergefQ80YD6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SergefQ80YD6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SergefQ80YD6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SergefQ80YD6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SergefQ80YD6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SergefQ80YD6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SergefQ80YD6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SergefQ80YD6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SergefQ80YD6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SergefQ80YD6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SergefQ80YD6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SergefQ80YD6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SergefQ80YD6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SergefQ80YD6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SergefQ80YD6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SergefQ80YD6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SergefQ80YD6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SergefQ80YD6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SergefQ80YD6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SergefQ80YD6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SergefQ80YD6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms