Protein–RNA interactions for Protein: Q80V24

Vgll4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll4Q80V24 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vgll4Q80V24 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll4Q80V24 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms