Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC37.5■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NischQ80TM9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
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