Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LnpkQ7TQ95 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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