Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ShprhQ7TPQ3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ShprhQ7TPQ3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ShprhQ7TPQ3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ShprhQ7TPQ3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ShprhQ7TPQ3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ShprhQ7TPQ3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ShprhQ7TPQ3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ShprhQ7TPQ3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ShprhQ7TPQ3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ShprhQ7TPQ3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ShprhQ7TPQ3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ShprhQ7TPQ3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ShprhQ7TPQ3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ShprhQ7TPQ3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ShprhQ7TPQ3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ShprhQ7TPQ3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ShprhQ7TPQ3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ShprhQ7TPQ3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ShprhQ7TPQ3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ShprhQ7TPQ3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ShprhQ7TPQ3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ShprhQ7TPQ3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ShprhQ7TPQ3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ShprhQ7TPQ3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ShprhQ7TPQ3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ShprhQ7TPQ3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ShprhQ7TPQ3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ShprhQ7TPQ3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ShprhQ7TPQ3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ShprhQ7TPQ3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ShprhQ7TPQ3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ShprhQ7TPQ3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ShprhQ7TPQ3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ShprhQ7TPQ3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ShprhQ7TPQ3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ShprhQ7TPQ3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ShprhQ7TPQ3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ShprhQ7TPQ3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ShprhQ7TPQ3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ShprhQ7TPQ3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms