Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prrc2bQ7TPM1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms