Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mycbp2Q7TPH6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mycbp2Q7TPH6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Mycbp2Q7TPH6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mycbp2Q7TPH6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mycbp2Q7TPH6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mycbp2Q7TPH6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mycbp2Q7TPH6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mycbp2Q7TPH6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mycbp2Q7TPH6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mycbp2Q7TPH6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mycbp2Q7TPH6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mycbp2Q7TPH6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mycbp2Q7TPH6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mycbp2Q7TPH6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms