Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd3eapQ76KJ5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms