Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms