Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms