Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ncapd3Q6ZQK0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms