Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nup188Q6ZQH8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms