Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Topbp1Q6ZQF0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms