Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp34Q6ZQ93 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms