Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ino80Q6ZPV2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms