Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smpd4Q6ZPR5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms