Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms