Protein–RNA interactions for Protein: Q6VYH9

Hsh2d, Hematopoietic SH2 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsh2dQ6VYH9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hsh2dQ6VYH9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms