Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Rhox8Q6VSS7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Rhox8Q6VSS7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rhox8Q6VSS7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rhox8Q6VSS7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rhox8Q6VSS7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rhox8Q6VSS7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rhox8Q6VSS7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rhox8Q6VSS7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rhox8Q6VSS7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rhox8Q6VSS7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rhox8Q6VSS7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rhox8Q6VSS7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms