Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ0

Cd300a, CMRF35-like molecule 8, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300aQ6SJQ0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd300aQ6SJQ0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd300aQ6SJQ0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd300aQ6SJQ0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd300aQ6SJQ0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd300aQ6SJQ0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd300aQ6SJQ0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd300aQ6SJQ0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd300aQ6SJQ0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd300aQ6SJQ0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd300aQ6SJQ0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd300aQ6SJQ0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd300aQ6SJQ0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd300aQ6SJQ0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd300aQ6SJQ0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd300aQ6SJQ0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd300aQ6SJQ0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd300aQ6SJQ0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd300aQ6SJQ0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd300aQ6SJQ0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd300aQ6SJQ0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd300aQ6SJQ0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms