Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGL7

Washc2, WASH complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc2Q6PGL7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Washc2Q6PGL7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Washc2Q6PGL7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Washc2Q6PGL7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Washc2Q6PGL7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Washc2Q6PGL7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Washc2Q6PGL7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Washc2Q6PGL7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Washc2Q6PGL7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Washc2Q6PGL7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Washc2Q6PGL7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Washc2Q6PGL7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Washc2Q6PGL7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Washc2Q6PGL7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Washc2Q6PGL7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Washc2Q6PGL7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Washc2Q6PGL7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Washc2Q6PGL7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Washc2Q6PGL7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Washc2Q6PGL7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Washc2Q6PGL7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Washc2Q6PGL7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Washc2Q6PGL7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Washc2Q6PGL7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Washc2Q6PGL7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Washc2Q6PGL7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Washc2Q6PGL7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Washc2Q6PGL7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Washc2Q6PGL7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Washc2Q6PGL7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Washc2Q6PGL7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Washc2Q6PGL7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Washc2Q6PGL7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms