Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54bQ6PFE3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms