Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rundc3bQ6PDC0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms