Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms