Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slf2Q6P9P0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms