Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam222bQ6P539 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam222bQ6P539 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms