Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Podnl1Q6P3Y9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms