Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZA9

Taf9b, Transcription initiation factor TFIID subunit 9B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf9bQ6NZA9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf9bQ6NZA9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms