Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdcd11Q6NS46 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdcd11Q6NS46 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms