Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn11Q6J756 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn11Q6J756 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms