Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt40Q6IFX3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Krt40Q6IFX3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms