Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hecw2Q6I6G8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms