Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Edrf1Q6GQV7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Edrf1Q6GQV7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Edrf1Q6GQV7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Edrf1Q6GQV7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Edrf1Q6GQV7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Edrf1Q6GQV7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Edrf1Q6GQV7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Edrf1Q6GQV7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Edrf1Q6GQV7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Edrf1Q6GQV7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Edrf1Q6GQV7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Edrf1Q6GQV7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Edrf1Q6GQV7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Edrf1Q6GQV7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Edrf1Q6GQV7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms