Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col4a5Q63ZW6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms