Protein–RNA interactions for Protein: Q62458

Gm20809, (clone BALB14N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20809Q62458 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm20809Q62458 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm20809Q62458 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20809Q62458 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm20809Q62458 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm20809Q62458 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm20809Q62458 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm20809Q62458 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm20809Q62458 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm20809Q62458 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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